Моксифлоксацин применяется в терапии заболеваний, осложненных бактериальной инфекцией. Целесообразно назначение препарата при неэффективности или непереносимости других антибактериальных средств, при возникновении суперинфекции в результате развития резистентности патогенных микроорганизмов.